进口酶标仪实际上就是一台变相光电比色计或分光光度计，但是与分光光度计又有些许的不同。其基本工作原理与主要结构和光电比色计基本相同，光源灯发出的光波经过滤光片或单色器变成一束单色光，进入塑料微孔极中的待测标本，该单色光一部分被标本吸收，另一部分则透过标本照射到光电检测器上，光电检测器将这一待测标本不同而强弱不同的光信号转换成相应的电信号，电信号经前置放大，对数放大，模数转换等信号处理后送入微处理器进行数据处理和计算，再由显示器和打印机显示结果，微处理机还通过控制电路控制机械驱动机构X方向和Y方向的运动来移动微孔板，从而实现自动进样检测过程。
进口酶标仪与分光光度计的不同之处：
(1)盛装待测溶液的容器：分光光度计用的是比色皿，酶标仪使用的是塑料微孔板(酶标板)。比色皿只能起到盛装溶液的作用，每个比色皿一次只能盛装一种溶液。酶标板常用透明的聚乙烯材料制成，对抗原抗体有较强的吸附作用，因此用它作为固相载体，酶标板通常为48孔或96孔，每个微孔可以盛装不同的溶液。
(2)光路的方向：分光光度计是水平光路，而酶标仪则是垂直光路。由于酶标板盛样本的塑料微孔板是多排多孔的,光线只能垂直穿过,因此光束都是垂直通过待测溶液和微孔板的,光束既可是从上到下,也可以是从下到上穿过比色液。垂直光的特点是标本吸光度受液体浓缩或稀释的影响小，不足之处是受被测样本液面是否水平、酶标板透光性、孔底是否平整等的影响较大。
(3)光路的长度：由于光密度(OD值)与吸光系数,待测组分的浓度以及光路长度成正比关系。分光光度计采用的比色杯的宽度通常是25px，所以光路长度固定为25px。因此不同仪器，不同批次测量的数据具有同样的可比性。而酶标仪采用的是垂直光路,所以光路的长度应该是液体液面的高度，所以测得的值受到样品的体积的影响。
