在高压灭菌锅的操作中，应保证操作中的安全性，这就要求使用者应按照相关规范进行操作，其中包括：
1、在灭菌前将双层的高压灭菌带包好，废物在灭菌袋中的体积不能超过袋子体积的3/4，灭菌袋用橡皮带捆好，但不能扎得太死，否则蒸汽不能进入所料袋内影响灭菌效果。
2、实验产生的废物应及时就地灭菌处理，如果灭菌器正在使用或优于其它原因不能马上使用，则废物必须放在灭菌袋内捆好并放在实验室内，在存放期间确保袋子无损坏。
3、当高压灭菌锅消毒灭菌盗时间后，取出物品放在废物收集处。
除此之外，必要的维护与保养工作对于有效延长高压灭菌锅使用寿命也会有很大的作用，其中：
1、每日灭菌前检查灭菌器上盖、压力探头、蒸汽调节阀、安全阀等是否处于完好状态。清除灭菌器腔内排气口的异物，防止管路堵塞，保证排气通畅；用抹布擦洗密封橡胶圈表面，除去密封橡胶圈上的异物,确保灭菌器的密封性。
2、每周清洗一次灭菌腔，清洗腔内壁应使用无氯的清洗剂，在特殊的情况下，可以偶尔对难以擦干净的地方使用去污粉或含铬的清洗剂，但不能使用钢刷，避免对不锈钢腐蚀。
3、每年一次的整机检测、维护保养由专业技术人员进行。
