高压灭菌是将待灭菌的物品放在一个密闭的加压灭菌锅内，通过加热，使灭菌锅隔套间的水沸腾而产生蒸汽。待水蒸汽急剧地将锅内的冷空气从排气阀中驱尽，然后关闭排气阀，继续加热，此时由于蒸气不能溢出，而增加了灭菌锅内的压力，从而使沸点增高，得到高于100℃的温度，导致菌体蛋白质凝固变性而达到灭菌的目的。在使用全自动高压灭菌锅灭菌时，灭菌锅内冷空气的排除是否*极为重要，因为空气的膨胀压大于水蒸汽的膨胀压，所以，当水蒸汽中含有空气时，在同一压力下，含空气蒸汽的温度低于饱和蒸汽的温度，所以饱和蒸汽的灭菌更*。
影响全自动高压灭菌锅灭菌效果的因素有很多，其中包括：水、蒸汽的干燥程度以及灭菌时间等等，任一因素发生改变都会影响到后期的灭菌效果，其中：
1、灭菌时间：是指灭菌过程中灭菌室内达到规定温度后灭菌所需时间，操作中，应注意观察蒸汽的进汽速度和压力, 一般保持压力和温度同步上升。
2、干燥程度：全自动高压灭菌锅应使用干燥程度不小于0.9的饱和蒸汽，即蒸汽含水量不超过10%，金属负载状态下，干燥程度不小于0.95以保持温度与压力符合线性关系。
3、水：水温过高可能会导致预定的真空水平改变，水温应尽量低。灭菌锅使用的水应符合应用水质量，并且温度不超过15℃，水的硬度值在0.7～2.0mmoL /L之间。超出该范围的硬度值可能会引起水垢和腐蚀等问题。从而缩短灭菌锅的使用寿命，使用的水需经过过滤和处理，应保持锅体清洁。
在全自动高压灭菌锅的灭菌过程中，应注意排净锅内冷空气，锅内冷空气如排放不净，会影响灭菌效果，达不到*灭菌的目的。由于高压蒸汽灭菌时，要使用温度高达120℃、两个大气压的过热蒸汽，操作时，必须严格按照操作规程操作，否则容易发生意外事故。
如果在运行过程中遇到了全自动高压灭菌锅出现故障的时候，使用者应掌握一些必要的应急处理方法，其中包括：
1、仪器异常报警时先检查压力表指示，如超过允许zui大压力而安全阀没有跳起，应立即切断电源并将排气阀旋到zui大。
2、观察水位指示灯工作情况，如缺水应切断电源并放气至压力表指示为“0”后打开上盖，加水至"高水位"指示灯亮后在接通电源工作。
3、控制面板上温度指示异常而压力表指示正常则应调节排气阀旋钮，使其尽量一致。
4、如压力表指示正常应观察联锁指示灯和压力指示灯的工作情况，如异常应记录并上报。
5、如有不明原因而报警应立即切断电源并上报，同时必须在压力表指示为“0”时才可打开上盖取出灭菌物品，zui后通知专业维修人员进行维修。
